以刘幽求为首的政变功臣、文武百官，亦纷纷联名上奏，全力支持李隆基入主东宫。
朝野人心所向、大义当前，李旦最终下定决心，正式册立李隆基为皇太子，为日后开元盛世的诞生奠定了根基。
李隆基被立为太子后，势力日渐强盛、威望与日俱增，逐渐掌控朝政实权，由此与太平公主产生激烈的权力冲突。
太平公主自恃拥立睿宗、参与政变有功，加之深得李旦信任，常年干预朝政、把持朝局，朝中半数官员皆出自其门下党羽。李隆基的崛起，彻底阻碍了其独揽大权、操控朝政的野心。
为保住自身权势、掌控朝堂，太平公主决意更换储君、废除李隆基。她暗中在朝野大肆散布流言，宣称李隆基并非嫡长子、继位不合礼制、无储君资格，意图动摇太子根基、败坏其声望。李旦得知流言后，公开下诏宣谕朝野、力挺太子，彻底平息流言，挫败太平公主的第一次图谋。
流言失效后，太平公主变本加厉，暗中在太子东宫安插大量耳目亲信，全程监视李隆基的言行举止、伺机罗织罪名；同时与窦怀贞等宰相重臣结党，抱团对抗太子势力，暗中密谋加害李隆基。
二者的权力矛盾日益激化、彻底公开化。太平公主甚至公然在宣政殿光范门拦截当朝宰相，暗示众臣联名劝谏皇帝、改立太子，意图以朝堂压力逼迫李旦妥协，却遭到宰相宋璟的严词驳斥，其阴谋再度落空。
景云二年二月丁丑日（711年2月23日），为化解朝堂党争、平衡皇权、稳固太子地位，李旦采纳姚崇、宋璟、张说等忠臣良相的谏言，正式下诏命太子李隆基监国，全权处理日常朝政政务。
同时为杜绝诸王干政、威胁储位，朝廷尽数削去李成器等宗室诸王的兵权与实权；为分化太平公主势力、遏制其干政野心，下诏令太平公主迁居蒲州（今山西永济），远离京师朝堂。
此举彻底触动了太平公主的核心利益，她即刻入宫面见李旦、哭诉陈情、百般哀求。素来温和心软、顾念兄妹情义的李旦，最终不忍逼迫，准许太平公主留居京师。不仅如此，为安抚其情绪，他还将忠心为国、力整朝纲的姚崇、宋璟二相贬出朝堂，导致朝堂制衡格局再度失衡，太平公主势力死灰复燃、愈发猖獗。
此后，李旦深感朝堂纷争难解、权力制衡艰难，心生倦政之意，屡次想要禅位于太子李隆基。虽因文武百官极力劝谏、以社稷未稳为由阻拦，禅位之举暂时搁置，但李旦已然彻底放权，将朝堂绝大多数政务全权交由太子李隆基处置
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