怪也给放了出来。
而此时已经晚了，这些被抓走的口袋妖怪都被复制出了一个复制体，出现在了众人的面前，然后幕后黑手终于露面了，就是那个曾经试图杀死小智的黑影，自称为超梦的口袋妖怪。
从超梦的口中，小智等人终于得知了事情的真相，原来超梦是用梦幻的眼睫毛复制出来的口袋妖怪，而因为制造超梦的火箭队组织，试图制造出世界上最强的口袋妖怪，于是给超梦增加了很多复杂的基因，同时也让超梦的性格变得非常的暴躁与阴暗。
苏醒过来的超梦毁掉了火箭队的基地，但同时又被火箭队的板木老大给控制住了，在被板木老大利用了一阵子之后，超梦就深深的恨上人类，于是他挣脱了板木老大的束缚，来到了这个大海中央的小岛，也是他曾经出生的地方，然后再毁灭人类最杰出的训练师，最后彻底毁掉人类这个恶心的种族。
同时超梦心中还有一个一直困扰着他的疑问，那就是复制品和本尊，究竟谁才是本尊，谁才能够活下来！
于是在超梦的控制下，复制品口袋妖怪和本尊开始战斗了起来，复制品们都想要击杀本尊，然后成为真正的本尊。
而本尊自然要维护自己的存在。
就在所有的口袋妖怪都为了维护自己的存在而战斗的时候，皮卡丘却不走寻常路，它不愿意和它的复制品战斗，于是就出现了口袋妖怪影史上最为著名的一幕，皮卡丘站在原地，任由复制品皮卡丘一巴掌一巴掌的扇在自己的脸上也绝不还手，只是眼含泪光的看着自己的复制品。
这是什么境界，佛的境界呀！
在一口气打了几十个巴掌之后，复制品终于受不了了，它停下了自己愤怒的巴掌，它也同样饱含泪光，然后两个皮卡丘抱在了一起，他们之间的心结终于解开了。
不管复制品还是本尊，从他们诞生那一刻起，就是口袋妖怪了，没有必要为了自己的存在而战斗，大家都是亲如兄弟的一家人。
随着两个皮卡丘战斗的结束，看到这一幕的其他口代妖怪也渐渐的停下了战斗，用复杂的目光看着另一个自己，整个会场变得一片安静，只剩下愤怒的超梦，在空中愤怒着。